Ба сохтори  Вазорати энергетика ва захираҳои оби Ҷумҳурии Тоҷикистон дохил мешаванд:

  1. Дастгоҳи марказӣ
  2. Хадамоти давлатӣ оид ба назорат дар соҳаи энергетика
  3. Хадамоти давлатӣ оид ба назорат дар соҳаи бехатарии иншооти гидротехникӣ

Номгӯи корхона ва муассисаҳо дар низоми Вазорати энергетика ва захираҳои оби Ҷумҳурии Тоҷикистон

  1. Ҷамъияти саҳомии кушодаи «Помир Энерҷӣ»
  2. Ҷамъияти саҳомии кушодаи «Тоҷиктрансгаз»
  3. Корхонаи воҳиди давлатии ҷумҳуриявии «Пажуҳишгоҳи лоиҳакашии «Нурофар»»
  4. Муассисаи давлатии «Тоҷик НИИГиМ»
  5. Муассисаи давлатии таълимии «Донишкадаи энергетикии Тоҷикистон»
  6. Муассисаи давлатии таълимии «Колеҷи энергетикии ноҳияи Ҷалолиддини Румӣ»
  7. Шуъбаи тоҷикии Идораи иншооти нақби обӣ ва канали «Дустлик» -и даштҳои ташналаб
  8. Раёсати болодарёии иттиҳодияи ҳавзаи хоҷагии оби «Амударё»
  9. Котиботи Комиссияи байнидавлатии ҳамоҳангсозии хоҷагии оби Осиёи Марказӣ
  10. Филиали тоҷикистонии Маркази илмию иттилоотии Комиссияи байнидавлатии ҳамоҳангсозии хоҷагии оби Осиёи Марказӣ
  11. Муассисаи давлатии маҷаллаи «Энергетика ва захираҳои об»
  12. Боғчаи кўдаконаи № 133
  13. Раёсати захираҳои оби минтақаи ҳавзавии Сырдарё
  14. Раёсати захираҳои оби минтақаи ҳавзавии Зарафшон
  15. Раёсати захираҳои оби минтақаи ҳавзавии Кофарниҳон
  16. Раёсати захираҳои оби минтақаи ҳавзавии Вахш
  17. Раёсати захираҳои оби минтақаи ҳавзавии Панҷ