В структуру управления Министерства энергетики и водных ресурсов Республики Таджикистан входят:
- Центральный аппарат.
- Государственная служба по надзору в области энергетики
- Служба по государственному надзору в сфере безопасности гидротехнических сооружений
Перечень предприятий и учреждений системы Министерства энергетики и водных ресурсов Республики Таджикистан
- Акционерное общество открытого типа «Помир-энерчи»
- Открытое акционерное общество «Точиктрансгаз»
- Республиканское государственное унитарное предприятие «Научно-исследовательский и проектный институт «Нурофар»
- Государственное учреждение «ТочикНИИГиМ» (Научно-исследовательский институт гидротехники и мелиорации)
- Государственное образовательное учреждение «Институт энергетики Таджикистана»
- Государственное образовательное учреждение «Энергетический колледж района Джалолидини Руми»
- Таджикское отделение Голодностепского управления гидроузлов и канала «Дустлик»
- Верхнеамударьинское управление бассейнового водохозяйственного объединения «Амударья»
- Секретариат Межгосударственной координационной водохозяйственной комиссии
- Таджикский филиал Научно-информационного центра Межгосударственной координационной водохозяйственной комиссии Центральной Азии
- Государственное учреждение журнал «Энергетика ва захирахои об»
- Детский сад №133
- Управление водными ресурсами бассейновой зоны Cырдарья
- Управление водными ресурсами бассейновой зоны Зарафшон
- Управление водными ресурсами бассейновой зоны Кафирниган
- Управление водными ресурсами бассейновой зоны Вахш
- Управление водными ресурсами бассейновой зоны Пяндж